Beta-2-糖蛋白 1(β2GP1)，也称为载脂蛋白H (APOH)、活化蛋白C结合蛋白、B2GPI 和 B2G1，是一种由肝细胞合成的糖蛋白，它存在于与血浆脂蛋白相关的血液中。它是某些抗磷脂抗体 (APA) 与阴离子磷脂结合的重要辅助因子。β2GP1 与各种带负电荷的物质结合，如肝素、磷脂和硫酸葡聚糖。β2GP1可以通过与受损细胞表面的磷脂结合来阻止内在凝血级联反应的激活。β2GP1似乎完全抑制血小板释放血清素，并防止 ADP 诱导的聚集的后续波。β2GP1的活性似乎涉及凝集带负电荷的化合物的结合，并通过内在凝血途径的接触激活抑制凝集。当凝血酶以β2GP1的生理血清浓度存在时，β2GP1会导致血小板上凝血酶原酶结合位点的减少，并减少由胶原蛋白引起的活化，这表明β2GP1在凝血中的调节作用β2GP1血浆浓度与 2 型糖尿病患者的代谢综合征改变和血管疾病密切相关，可被视为心血管风险的临床标志物。β2GP1存在于几类脂蛋白上，并参与脂质代谢中脂蛋白脂肪酶的激活。这种单链糖蛋白也与多种生理途径有关，包括凝血和高血压的产生。

组氨酰 tRNA 合成酶是氨酰 tRNA 合成酶家族的成员，是蛋白质生物合成的关键酶，它为 tRNA 分子提供相应的氨基酸。这种 58 kDa 蛋白是一种自身抗原，可被 Jo-1 抗体识别，33% 的多发性肌炎和皮肌炎患者中会出现这种抗体。Jo-1 抗体表明肺部受累的风险增加，并且这种疾病往往会发展得很严重，对治疗的反应很差。

SS-B，也称为La自身抗原，是一种47 kDa的自身免疫性RNA结合蛋白，在RNA 聚合酶III的转录中起作用。SS-B最初被鉴定为一种自身抗原，可被系统性红斑狼疮和干燥综合征患者的血清识别。它主要位于细胞核内，在RNA聚合酶III转录物的成熟和双链RNA的解旋中起作用。SS-B结合的病毒靶标包括一些小核糖核酸病毒、HCV、流感病毒、sindbis 病毒和 HIV TAR 元件的5ʹ-UTR。就脊髓灰质炎病毒而言，SS-B在翻译的内部起始中发挥功能性作用，其中将纯化的 La 添加到兔网织红细胞裂解物 (RRL) 中，可抑制体外翻译试验中异常翻译产物的积累，并导致适度的翻译刺激。SS-B 也已被证明可以刺激由脑心肌炎病毒 (EMCV) 和 HCV 的 IRES 元件引导的翻译。

蛋白酶3是中性粒细胞胞浆嗜天青颗粒中的一种丝氨酸蛋白酶，分子量约为29KDa的糖蛋白。PR3能降解多种细胞外基质如弹性蛋白、血红蛋白、IV型胶原等多种组织成分。此外，蛋白酶3通过组织蛋白酶G促进血小板活化，并使C1抑制剂失活 是一种有效的蛋白酶。

髓过氧化物酶(myeloperoxidase,MPO),是一种血红素蛋白，富含于中性粒细胞中,由粒细胞进入循环之前在骨髓内合成并存储于噬天青颗粒内。外界刺激可导致中性粒细胞聚集，从而释放髓过氧化物酶。MPO被认为是最有前景的心血管标志物，体内MPO含量升高预示着有动脉硬化以及冠心病的风险，是心肌梗死的早期预警。

ICA512（或 IA-2/PTPRN）是一种跨膜蛋白酪氨酸磷酸酶，位于神经内分泌细胞的分泌颗粒中。胰岛细胞自身抗原 512 (ICA512)/IA-2 是一种受体酪氨酸磷酸酶样蛋白，与胰腺 β 细胞的胰岛素分泌颗粒 (SG) 相关。ICA512 是一种内在颗粒膜蛋白，其胞质结构域结合 β2-syntrophin（一种 F-肌动蛋白相关蛋白），并在颗粒胞吐作用时裂解。由此产生的裂解胞质片段 ICA512-CCF 到达细胞核并上调颗粒基因的转录，包括胰岛素和 ICA512。